Nature:粘连蛋白释放因子Wapl有助于V基因重排的机制

2021-12-13 00:12:29 来源:
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细胞膜核内的一些生物学现实生活,比如V(D)J醛,通常是由染色体三维构象所游离,之外染色体区室(compartments)、拓扑相关亚基(topologically associated domains, 又称TADs)和肝细胞外环(chromatin loop)等。TADs是由肝细胞外环先用(chromatin-loop extrusion)所构成的,而这一现实生活举例来说圆外环形状的复合抗原亚基(cohesion complex)。与之相对应以的是,复合抗原获释变异Wapl可以限制肝细胞外环的衔接(loop extension),从而起到负向游离的依赖性。

一系列特异性的产生,构成了体液免疫抵御外来寄生虫的主要糖类,而特异性的多样性,是由V(D)J醛所构建的,这一现实生活,举例来说Pax5所介导的2.8Mb长肝细胞重链(immunoglobulin hey chain,又称lgh)启动子的闭合。然而在在此之前体B细胞膜(pre-B cells)里,Pax5是如何游离lgh闭合的,仍旧不得而知。

近日,来自奥地利Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger研究团队在Nature上公开发表题为Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的篇文章,阐释Pax5通过抑止Wapl,从而构建对lgh的游离。

因为肝细胞外环先用举例来说黏性连抗原亚基,所以,创作者首先研究在在此之前体B细胞膜里,复合抗原亚基各组分的传达否发生推移。创作者推测,在RNA技术水平上,相较于其他各种类型的免疫细胞膜,在此之前体B细胞膜和原B细胞膜(pro-B cell)的的Wapl技术水平下调了四倍。抗原质技术水平也有相似的推测。这些结果暗示,黏性连抗原获释变异Wapl的下调,很意味著增大黏性连抗原在肝细胞上的存留时间。

有报道指出,Pax5可以游离lgh启动子闭合,创作者每一次论述,Pax5否可以不良影响Wapl在在此之前体B细胞膜里的传达。创作者通过Pax5突变缺陷活体推测,缺失了Pax5的在此之前体B细胞膜,Wapl的mRNA技术水平增大了4~6倍。另外,在此之前体B细胞膜里,Wapl上长期存在2个Pax5联结启动子P1和P2,而在萌芽的B细胞膜里,联结启动子减缓至1个(仅剩P2)。这些结果暗示,在在此之前体B细胞膜里,Pax5可以抑止Wapl技术水平。

在P1敲除活体里,肝脏里的B细胞膜发育或多或少上到在在此之前体B细胞膜下一阶段,这暗示,B细胞膜发育是受Wapl上Pax5联结启动子P1所游离的。另外,通过VDJ测序,创作者推测,P1敲除的活体,在此之前体B细胞膜里VDJH的醛%实着减缓。而在Pax5敲除活体里,也同样推测相似的现象,并且,Pax5活体lgh启动子无法进行闭合。这些结果暗示,Wapl上的Pax5联结启动子P1可以游离lgh肝细胞外环先用。

最终,创作者关注Pax5对Wapl的抑止,否时会不良影响在此之前体B细胞膜整个染色体的形态。创作者推测,只有在B细胞膜发育的早期下一阶段,Pax5可以不良影响黏性连抗原在肝细胞上的待命时间。并且,与正常的在此之前体B细胞膜相比,Pax5敲除活体的在此之前体细胞膜和P1,P2敲除的在此之前B细胞膜,其TADs里肝细胞外环的构成技术水平实着减缓;与此相对的是,荒地段的肝细胞闭合,从而构成染色体间隔的技术水平,却大大升高。这些结果暗示,在原B细胞膜里,Pax5的联结启动子P1所游离的Wapl技术水平减缓,明实不良影响了整个细胞膜的染色体形态。

综上所述,创作者推测,在在此之前体B细胞膜和原B细胞膜里,Pax5可以抑止黏性连抗原获释变异Wapl的传达,从而延长黏性连抗原在肝细胞上的待命时间,进而促进肝细胞外环先用技术水平的升高。这一现实生活是通过Wapl上的Pax5联结启动子P1构建的。而且,Wapl传达技术水平的减缓,可以引起染色体形态的整体而言推移,这也是在此之前体B细胞膜里发生高技术水平的V突变醛的意味著原因之一。

值得一提的是,就在这篇Nature上线后的翌日,先于影印bioRxiv上因特网披露了来自哈佛大学Frederich Alt实验室题为“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的相似工作,同样证明Wapl通过不良影响肝细胞外环先用不良影响突变醛的重要依赖性。

原始出处:

Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.

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